Het doel van Mainline is het bevorderen van de gezondheid van (hard-)druggebruikers en het verbeteren van de kwaliteit van hun leven.

Mainline zet zich in voor klassieke harm reduction interventies zoals spuitomruil, opiaat-substitutiebehandeling, hiv zorg: testen, behandelen, ondersteunen, bestrijding van infectieziekten zoals hepatitis B en C, tuberculose en seksueel overdraagbare aandoeningen, verspreiden van informatie, educatie en communicatie-materialen en overdosis preventie en management.